Štěpán Chalupník se narodil 19.12.1971 v Novém Městě na Moravě. Vystudoval Lékařskou fakultu Masarykovy univerzity – obor všeobecné lékařství (1996). V roce 1999 složil atestaci z chirurgie I. stupně , v roce 2005 pak atestaci z chirurgie II. stupně . Od července 1996 až dosud pracuje jako chirurg na I. chirurgické klinika FN U sv. Anny v Brně. Od roku 2009 pracuje i v soukromé chirurgické ambulanci – I. chirurgická s.r.o. Dobrovského 23, Brno.
Je členem ČLK, České lékařské společnosti Jana Evangelisty Purkyně, České společnosti robotické chirurgie.
Kromě řady stáží v České republice absolvoval i pracovní stáže ve Francii a USA.
Je autorem článků a přednášek zabývajících se robotickou chirurgii, chirurgii pánevního dna a kolorektální chirurgii.
Dlouhodobě se specializuje na kolorektální chirurgii, chirurgii pánevního dna a anorektální chirurgii.